雖然《寶可夢：朱/紫》自上線以來銷量非常可觀，但是對於遊戲的評價卻不像銷量那麼高，雖然這也是《寶可夢》系列最近幾部作品的常態，但是新作《朱/紫》相比前面幾部作品，評價更低，其原因在於遊戲的優化實在太差。

《寶可夢：朱/紫》因為優化太差，經常出現各種BUG，幀數也非常不穩定，任天堂官方也十分罕見的通過媒體向玩家道歉。

在接受《金融郵報》採訪時，任天堂加拿大分公司總經理正面回應了玩家在《寶可夢：朱/紫》中遇到的各種性能和優化問題，“你知道，我們必須道歉。因為讓玩家在遊戲中獲得積極的體驗非常重要，當這種情況沒有發生時，我們會非常在意。我能說的是，來自玩家的反饋絕對是非常認真的。我們正在努力完善這款遊戲。”

任天堂官方在發布《寶可夢：朱/紫》1.1.0版本更新的更新檔說明時也發表了類似的聲明，“我們認真對待玩家的反饋，正在努力改進遊戲。”

按照官方計劃，《寶可夢：朱/紫》1.2.0版本更新預計在2月底推出，預計將解決一些BUG並且增加新的功能。